以太基金会（日文︰エーテル財団ざいだん，英文︰Aether Foundation）是《太阳／月亮》中出现的组织，于阿罗拉地区保护受伤的宝可梦，尤其是被骷髅队伤害过的宝可梦。基地为位于阿罗拉地区的人工岛屿“以太乐园”。
游戏中
行政
以太基金会的理事长为喜爱宝可梦的露莎米奈，分部长扎奥博和副分部长碧珂也一起帮她处理基金会。基金会也会派人到野外去保护及拯救受害的宝可梦。
研究
以太基金会进行各式各样的研究活动，其中包括关于究极异兽的研究。究极异兽有着各自的代号。在《究极之日／究极之月》中会与究极调查队和阿克罗玛共同进行研究。
基地
以太基金会的基地为私人拥有的人工岛屿以太乐园，基地同时当为宝可梦避难所及研究设施。
剧情
剧透提示：以下内容可能包含主要情节或结局的细节，请谨慎阅读。
在游戏开始时，莉莉艾将科斯莫古从以太乐园带走。在走投无路之时，科斯莫古用自己的能力将莉莉艾瞬移。
主角通过阿卡拉岛大考验后，碧珂会带领主角前往以太乐园参观，并与露莎米奈见面，期间虚吾伊德突然从究极之洞出现而后又消失。
魄镇事件过后，主角发现骷髅队劫持猫鼬少“少少”是调虎离山计，而在此期间莉莉艾被迫被骷髅队带走。之后在格拉吉欧的带领下，主角和哈乌再度前往以太乐园。
在以太乐园，主角一行人受到了以太基金会的堵截。而在B2层的秘密实验室，主角逐渐了解到了以太基金会的黑幕。在和扎奥博对战后，主角获得了前往露莎米奈宅邸的钥匙。最终在宅邸深处，主角得知露莎米奈和莉莉艾的母女身份。露莎米奈随后利用科斯莫古打开了究极之洞，与古兹马一起前往了究极空间。此时究极调查队才知道他们被露莎米奈算计了。
莉莉艾与主角休整一夜后，决定鼓起勇气，寻找拯救母亲的办法，而此时以太基金会不再与主角敌对。
在主角于究极空间与露莎米奈对峙后，露莎米奈陷入了昏迷。莉莉艾决定前往关都地区寻找治疗母亲的方法，而格拉吉欧则成为以太基金会的代理理事长。在究极异兽事件期间，碧珂因为以太基金会的过错，决定帮助国际警察保护并研究极异兽，以解开究极异兽之谜。
在主角到达日轮祭坛US/月轮祭坛UM以后，露莎米奈出现并警告主角一行人这个世界正遭到奈克洛兹玛的袭击。主角成为冠军后格拉吉欧决定前往关都地区锻炼自己。随后碧珂再次与究极调查队联手研究究极异兽。期间因为扎奥博的阴谋露莎米奈的宅邸沦为彩虹火箭队的城堡，露莎米奈陷入昏迷，莉莉艾将与主角共同面对彩虹火箭队。
以太基金会的名字取自“以太”，即古希腊及中世纪所称的第五元素，源于古希腊神话中的太空之神埃忒耳，相传其为诸神所呼吸的天堂空气的神格。
法德意西版本中采用了其拉丁文拼法。
以太基金会是主系列游戏中第一个在宣传过程中以友善组织出现，在游戏中因为特殊事件成为邪恶组织，事后又再度与主角友善的组织。
由于基金会的本质仍然是友善组织，以太基金会是唯一一个由于领导者的私利而导致对主角有敌对行为的组织。
以太基金会是游戏中唯一一个雇佣其他邪恶组织的组织。
根据哈乌与碧珂的对话，可以得知以太基金会过去并不在阿罗拉地区活动。
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